非大疱性黄水疮常常由金黄色葡萄球菌引起，偶尔由A组β型溶血性链球菌引起，皮肤轻微外伤后细菌粘附、侵入并导致感染。大疱性黄水疮由金黄色葡萄球菌导致，可发生于完整的皮肤，该菌可产生并释放表皮剥脱毒素，表皮剥脱毒素与细胞表面的桥粒芯糖蛋白1结合，造成表皮细胞间粘附丧失，细胞松解，大疱形成。
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